Difference between revisions of "Manual Ratón"

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== Manual para la manipulación de las moléculas en Jmol usando el ratón ==
 
== Manual para la manipulación de las moléculas en Jmol usando el ratón ==
  
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Notas:
 
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# En la configuración habitual, el 'botón principal' es el izquierdo, y el 'botón secundario' el derecho.
 
# En la configuración habitual, el 'botón principal' es el izquierdo, y el 'botón secundario' el derecho.
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<td></td>
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<td>'''botón principal'''</td>
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<td>'''botón principal'''</td>
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<td>(izquierdo)</td>
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<td>(derecho)</td>
<td colspan="4"></td>
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</tr></tr>
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<td>'''Abrir menú de Jmol'''</td>
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<td colspan="4"></td>
<td>Ctrl. + clic<br />o clic sobre el logotipo 'Jmol'</td>
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<td></td>
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<td>clic</td>
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<td>'''Abrir menú de Jmol'''</td>
</tr><tr>
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<td>Ctrl. + clic<br />o clic sobre el logotipo 'Jmol'</td>
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<td></td>
</tr><tr>
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<td>clic</td>
<td>'''Rotar en torno a X,Y'''</td>
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<td>arrastrar</td>
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<td></td>
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<td></td>
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</tr><tr>
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<td>'''Rotar en torno a X,Y'''</td>
</tr><tr>
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<td>arrastrar</td>
<td>'''Mover a lo largo de X,Y (= trasladar)'''</td>
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<td></td>
<td>Mayús. + doble-clic y arrastrar</td>
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<td></td>
<td>doble-clic y arrastrar</td>
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</tr>
<td>Ctrl. + arrastrar</td>
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<td colspan="4"></td>
<td></td>
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</tr>
<td colspan="3" align="center">''el clic puede hacerse tanto sobre la molécula como fuera de ella''</td>
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</tr><tr>
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<td>'''Mover a lo largo de X,Y (= trasladar)'''</td>
<td colspan="4"></td>
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<td>Mayús. + doble-clic y arrastrar</td>
</tr><tr>
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<td>doble-clic y arrastrar</td>
<td>'''Restaurar y centrar'''</td>
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<td>Ctrl. + arrastrar</td>
<td>Mayús. + doble-clic*</td>
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</tr>
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<td></td>
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<td colspan="3" align="center">''el clic puede hacerse tanto sobre la molécula como fuera de ella''</td>
<td></td>
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<td colspan="3" align="center">''*el clic debe hacerse fuera de la molécula''</td>
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<td colspan="4"></td>
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<td>'''Rotar en torno a Z'''</td>
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<td>'''Restaurar y centrar'''</td>
<td>Mayús. + arrastrar en horizontal</td>
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<td>Mayús. + doble-clic*</td>
<td>arrastrar en horizontal</td>
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<td>doble-clic*</td>
<td>Mayús. + arrastrar en horizontal<br />(puede que falle en los Mac)</td>
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<td></td>
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<td colspan="4"></td>
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</tr><tr>
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<td></td>
<td>'''Reducir o ampliar'''</td>
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<td colspan="3" align="center">''*el clic debe hacerse fuera de la molécula''</td>
<td>Mayús. + arrastrar en vertical</td>
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</tr>
<td>arrastrar en vertical</td>
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<td></td>
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<td></td>
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<td colspan="3" align="center">o usar la rueda del ratón</td>
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<td>'''Rotar en torno a Z'''</td>
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<td>Mayús. + arrastrar en horizontal</td>
<td colspan="4"></td>
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<td>arrastrar en horizontal</td>
</tr><tr>
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<td>Mayús. + arrastrar en horizontal<br />(puede que falle en los Mac)</td>
<td></td>
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<td colspan="3" align="center">''Implementado sólo a partir de la versión premilinar Jmol 10.00.22:<br />Sólo funcionan tras una instrucción <tt>slab on</tt>''</td>
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<td colspan="4"></td>
<td>'''Seccionar desde el frente'''</td>
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<td>Ctrl.+Mayús. + arrastrar (en vertical) *</td>
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<td></td>
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<td>'''Reducir o ampliar'''</td>
<td></td>
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<td>Mayús. + arrastrar en vertical</td>
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<td>'''Seccionar desde atrás'''</td>
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<td></td>
<td>Ctrl.+Mayús. + doble-clic y arrastrar (en vertical) *</td>
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<td></td>
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<td colspan="3" align="center">o usar la rueda del ratón</td>
<td>'''Desplazar la sección''' (manteniendo constante su grosor)</td>
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<td></td>
<td colspan="3" align="center">''*si falla en un Mac, prueba pulsando primero el botón del ratón, luego pulsar las teclas Ctrl+Mayús., luego arrastrar''</td>
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<td colspan="3" align="center">''Implementado sólo a partir de la versión premilinar Jmol 10.00.22:<br />Sólo funcionan tras una instrucción <tt>slab on</tt>''</td>
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<td></td>
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<tr>
<td colspan="3" align="center">''Se puede probar el seccionado en [http://www2.uah.es/biomodel/pruebas/jmol/slab/inicio.htm esta página]''</td>
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<td>'''Seccionar desde el frente'''</td>
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<td>Ctrl.+Mayús. + arrastrar (en vertical) *</td>
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<td>'''Seccionar desde atrás'''</td>
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<td>Ctrl.+Mayús. + doble-clic y arrastrar (en vertical) *</td>
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<td>'''Desplazar la sección''' (manteniendo constante su grosor)</td>
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<td colspan="3" align="center">''*si falla en un Mac, prueba pulsando primero el botón del ratón, luego pulsar las teclas Ctrl+Mayús., luego arrastrar''</td>
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<td colspan="3" align="center">''Se puede probar el seccionado en [http://biomodel.uah.es/Jmol/slab/inicio.htm esta página]''</td>
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Latest revision as of 11:52, 14 June 2009

Jmol / JSmol Tutorials

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Manual para la manipulación de las moléculas en Jmol usando el ratón

Notas:

  1. En la configuración habitual, el 'botón principal' es el izquierdo, y el 'botón secundario' el derecho.
  2. Parece ser que en ratones de un solo botón Alt + arrastrar puede ser equivalente a arrastrar con el botón central.


botón principal botón central botón secundario
(izquierdo) (central) (derecho)
Abrir menú de Jmol Ctrl. + clic
o clic sobre el logotipo 'Jmol'
clic
Rotar en torno a X,Y arrastrar
Mover a lo largo de X,Y (= trasladar) Mayús. + doble-clic y arrastrar doble-clic y arrastrar Ctrl. + arrastrar
el clic puede hacerse tanto sobre la molécula como fuera de ella
Restaurar y centrar Mayús. + doble-clic* doble-clic*
*el clic debe hacerse fuera de la molécula
Rotar en torno a Z Mayús. + arrastrar en horizontal arrastrar en horizontal Mayús. + arrastrar en horizontal
(puede que falle en los Mac)
Reducir o ampliar Mayús. + arrastrar en vertical arrastrar en vertical
o usar la rueda del ratón
Implementado sólo a partir de la versión premilinar Jmol 10.00.22:
Sólo funcionan tras una instrucción slab on
Seccionar desde el frente Ctrl.+Mayús. + arrastrar (en vertical) *
Seccionar desde atrás Ctrl.+Mayús. + doble-clic y arrastrar (en vertical) *
Desplazar la sección (manteniendo constante su grosor) Alt.+Ctrl.+Mayús. + arrastrar (en vertical) *
*si falla en un Mac, prueba pulsando primero el botón del ratón, luego pulsar las teclas Ctrl+Mayús., luego arrastrar
Se puede probar el seccionado en esta página



Cómo seleccionar:

  • Usa la instrucción 'picking' adecuada; por ej.:

set picking group

para activar/desactivar la selección de un residuo aminoácido completo al hacer clic en uno de sus átomos:
  • al hacer clic en un átomo se cambiará su estado de selección.
  • Es más útil cuando se ha establecido

set display selected

de modo que se está resaltando la selección.


Cómo hacer mediciones:

  • Distancia (2 átomos):
    1. haz doble-clic en el átomo inicial
    2. para fijar una medición de distancia, haz doble-clic sobre el segundo átomo
  • Ángulo (3 átomos):
    1. haz doble-clic en el átomo inicial
    2. haz clic en el segundo átomo (átomo central del ángulo)
    3. para fijar una medición de ángulo, haz doble-clic sobre el tercer átomo
  • Ángulo de torsión o diedro (4 átomos)
    1. haz doble-clic en el átomo inicial
    2. haz clic en el segundo átomo
    3. haz clic en el tercer átomo
    4. para fijar una medición de ángulo diedro, haz doble-clic sobre el cuarto átomo
  • En todos los casos:
    • mueve el puntero sobre el átomo destino para ver la medida sin dejarla permanente
    • mueve el puntero fuera de la ventana para cancelar la medición
    • repite la medición para que desaparezca