Difference between revisions of "Sandbox"

From Jmol
Jump to navigation Jump to search
Line 3: Line 3:
 
== Jmol extension for MediaWiki ==
 
== Jmol extension for MediaWiki ==
  
 +
This uses <code>uploadedFileContents</code> tag with an XYZ file:
 
<jmol>
 
<jmol>
 
   <jmolApplet>
 
   <jmolApplet>
Line 48: Line 49:
 
</jmolMenu>
 
</jmolMenu>
 
</jmol>
 
</jmol>
 +
 +
 +
This one uses the <code>inlineContents</code> tag, with straight data on the left and with added pipe characters (|) on the right:
 +
<table width="100%"><tr>
 +
<td>
 +
<jmol>
 +
<jmolApplet>
 +
<size>150</size>
 +
<color>green</color>
 +
<inlineContents>chair.mol
 +
Conformational analysis
 +
0
 +
18 18  0  0  0                1 V2000
 +
    1.6881    2.1572  -3.0193 C  0  0  0  0  0
 +
    2.1484    3.6217  -2.9797 C  0  0  0  0  0
 +
    2.9361    3.9126  -1.6942 C  0  0  0  0  0
 +
    2.0927    3.5769  -0.4557 C  0  0  0  0  0
 +
    1.6329    2.1120  -0.4898 C  0  0  0  0  0
 +
    0.8532    1.8102  -1.7778 C  0  0  0  0  0
 +
    2.5807    1.4887  -3.0652 H  0  0  0  0  0
 +
    1.0897    1.9711  -3.9430 H  0  0  0  0  0
 +
    1.2578    4.2927  -3.0282 H  0  0  0  0  0
 +
    2.7791    3.8474  -3.8727 H  0  0  0  0  0
 +
    3.8725    3.3053  -1.6844 H  0  0  0  0  0
 +
    3.2413    4.9861  -1.6685 H  0  0  0  0  0
 +
    1.2005    4.2467  -0.4224 H  0  0  0  0  0
 +
    2.6835    3.7700    0.4714 H  0  0  0  0  0
 +
    0.9957    1.8928    0.4002 H  0  0  0  0  0
 +
    2.5240    1.4426  -0.4294 H  0  0  0  0  0
 +
    0.5642    0.7322  -1.8031 H  0  0  0  0  0
 +
  -0.0919    2.4039  -1.7878 H  0  0  0  0  0
 +
  1  2  1  0  0  0
 +
  1  6  1  1  0  0
 +
  1  7  1  0  0  0
 +
  1  8  1  6  0  0
 +
  2  3  1  1  0  0
 +
  2  9  1  0  0  0
 +
  2 10  1  6  0  0
 +
  3  4  1  1  0  0
 +
  3 11  1  0  0  0
 +
  3 12  1  0  0  0
 +
  4  5  1  0  0  0
 +
  4 13  1  0  0  0
 +
  4 14  1  1  0  0
 +
  5  6  1  6  0  0
 +
  5 15  1  1  0  0
 +
  5 16  1  0  0  0
 +
  6 17  1  0  0  0
 +
  6 18  1  0  0  0
 +
M  END
 +
</inlineContents>
 +
  </jmolApplet>
 +
</jmol>
 +
</td>
 +
<td>
 +
<jmol>
 +
<jmolApplet>
 +
<size>150</size>
 +
<color>green</color>
 +
<inlineContents>
 +
|chair.mol                                       
 +
|Conformational analysis                         
 +
|0                                               
 +
| 18 18  0  0  0                1 V2000         
 +
|    1.6881    2.1572  -3.0193 C  0  0  0  0  0 
 +
|    2.1484    3.6217  -2.9797 C  0  0  0  0  0 
 +
|    2.9361    3.9126  -1.6942 C  0  0  0  0  0 
 +
|    2.0927    3.5769  -0.4557 C  0  0  0  0  0 
 +
|    1.6329    2.1120  -0.4898 C  0  0  0  0  0 
 +
|    0.8532    1.8102  -1.7778 C  0  0  0  0  0 
 +
|    2.5807    1.4887  -3.0652 H  0  0  0  0  0 
 +
|    1.0897    1.9711  -3.9430 H  0  0  0  0  0 
 +
|    1.2578    4.2927  -3.0282 H  0  0  0  0  0 
 +
|    2.7791    3.8474  -3.8727 H  0  0  0  0  0 
 +
|    3.8725    3.3053  -1.6844 H  0  0  0  0  0 
 +
|    3.2413    4.9861  -1.6685 H  0  0  0  0  0 
 +
|    1.2005    4.2467  -0.4224 H  0  0  0  0  0 
 +
|    2.6835    3.7700    0.4714 H  0  0  0  0  0 
 +
|    0.9957    1.8928    0.4002 H  0  0  0  0  0 
 +
|    2.5240    1.4426  -0.4294 H  0  0  0  0  0 
 +
|    0.5642    0.7322  -1.8031 H  0  0  0  0  0 
 +
|  -0.0919    2.4039  -1.7878 H  0  0  0  0  0 
 +
|  1  2  1  0  0  0                               
 +
|  1  6  1  1  0  0                               
 +
|  1  7  1  0  0  0                               
 +
|  1  8  1  6  0  0                               
 +
|  2  3  1  1  0  0                               
 +
|  2  9  1  0  0  0                               
 +
|  2 10  1  6  0  0                               
 +
|  3  4  1  1  0  0                               
 +
|  3 11  1  0  0  0                               
 +
|  3 12  1  0  0  0                               
 +
|  4  5  1  0  0  0                               
 +
|  4 13  1  0  0  0                               
 +
|  4 14  1  1  0  0                               
 +
|  5  6  1  6  0  0                               
 +
|  5 15  1  1  0  0                               
 +
|  5 16  1  0  0  0                               
 +
|  6 17  1  0  0  0                               
 +
|  6 18  1  0  0  0                               
 +
|M  END                                           
 +
</inlineContents>
 +
  </jmolApplet>
 +
</jmol>
 +
</td>
 +
</tr></table>
 +
  
 
== Using a pop-up window ==
 
== Using a pop-up window ==
An image: [[Image:Ethane s.gif]]
+
An image used for illustration and a caption for requesting the Jmol model:
 
 
The image as a replacement until the user requests the Jmol model:
 
  
 
{|name="userboxes" id="userboxes" style="margin-left: 1em; margin-bottom: 0.5em; width: 170px; border: {{{bordercolor|#99B3FF}}} solid 1px; background-color: {{{backgroundcolor|#FFFFFF}}}; {{{extra-css|}}}" align="right"
 
{|name="userboxes" id="userboxes" style="margin-left: 1em; margin-bottom: 0.5em; width: 170px; border: {{{bordercolor|#99B3FF}}} solid 1px; background-color: {{{backgroundcolor|#FFFFFF}}}; {{{extra-css|}}}" align="right"

Revision as of 20:42, 30 November 2008

This is a page for testing.

Jmol extension for MediaWiki

This uses uploadedFileContents tag with an XYZ file:

Color atoms:


This one uses the inlineContents tag, with straight data on the left and with added pipe characters (|) on the right:


Using a pop-up window

An image used for illustration and a caption for requesting the Jmol model:

Ethane s.gif
Staggered ethane

Contributors

AngelHerraez