Manual Ratón

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Manual para la manipulación de las moléculas en Jmol usando el ratón

Notas:

  1. En la configuración habitual, el 'botón principal' es el izquierdo, y el 'botón secundario' el derecho.
  2. Parece ser que en ratones de un solo botón Alt + arrastrar puede ser equivalente a arrastrar con el botón central.


botón principal botón central botón secundario
(izquierdo) (central) (derecho)
Abrir menú de Jmol Ctrl. + clic
o clic sobre el logotipo 'Jmol'
clic
Rotar en torno a X,Y arrastrar
Mover a lo largo de X,Y (= trasladar) Mayús. + doble-clic y arrastrar doble-clic y arrastrar Ctrl. + arrastrar
el clic puede hacerse tanto sobre la molécula como fuera de ella
Restaurar y centrar Mayús. + doble-clic* doble-clic*
*el clic debe hacerse fuera de la molécula
Rotar en torno a Z Mayús. + arrastrar en horizontal arrastrar en horizontal Mayús. + arrastrar en horizontal
(puede que falle en los Mac)
Reducir o ampliar Mayús. + arrastrar en vertical arrastrar en vertical
o usar la rueda del ratón
Implementado sólo a partir de la versión premilinar Jmol 10.00.22:
Sólo funcionan tras una instrucción slab on
Seccionar desde el frente Ctrl.+Mayús. + arrastrar (en vertical) *
Seccionar desde atrás Ctrl.+Mayús. + doble-clic y arrastrar (en vertical) *
Desplazar la sección (manteniendo constante su grosor) Alt.+Ctrl.+Mayús. + arrastrar (en vertical) *
*si falla en un Mac, prueba pulsando primero el botón del ratón, luego pulsar las teclas Ctrl+Mayús., luego arrastrar
Se puede probar el seccionado en esta página



Cómo seleccionar:

  • Usa la instrucción 'picking' adecuada; por ej.:

set picking group

para activar/desactivar la selección de un residuo aminoácido completo al hacer clic en uno de sus átomos:
  • al hacer clic en un átomo se cambiará su estado de selección.
  • Es más útil cuando se ha establecido

set display selected

de modo que se está resaltando la selección.


Cómo hacer mediciones:

  • Distancia (2 átomos):
    1. haz doble-clic en el átomo inicial
    2. para fijar una medición de distancia, haz doble-clic sobre el segundo átomo
  • Ángulo (3 átomos):
    1. haz doble-clic en el átomo inicial
    2. haz clic en el segundo átomo (átomo central del ángulo)
    3. para fijar una medición de ángulo, haz doble-clic sobre el tercer átomo
  • Ángulo de torsión o diedro (4 átomos)
    1. haz doble-clic en el átomo inicial
    2. haz clic en el segundo átomo
    3. haz clic en el tercer átomo
    4. para fijar una medición de ángulo diedro, haz doble-clic sobre el cuarto átomo
  • En todos los casos:
    • mueve el puntero sobre el átomo destino para ver la medida sin dejarla permanente
    • mueve el puntero fuera de la ventana para cancelar la medición
    • repite la medición para que desaparezca
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