Manual Ratón

Jmol / JSmol Tutorials

• A list of Jmol / JSmol Tutorials written by users.
• Using the mouse (English · Español · Français · Japanese).
• Scripting quickstart: rendering options · selecting atoms.
• How to create surfaces and isosurfaces, including cavities, pockets and tunnels.
• Displaying shapes, polyhedra, orbitals, dipoles, distances, forces and vibrations.
• Creating movies.
• Customizing Jmol: macros · menus.
• Web pages without writing code by using the Jmol "Export to Web" function.

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Manual para la manipulación de las moléculas en Jmol usando el ratón

Notas:

1. En la configuración habitual, el 'botón principal' es el izquierdo, y el 'botón secundario' el derecho.
2. Parece ser que en ratones de un solo botón Alt + arrastrar puede ser equivalente a arrastrar con el botón central.

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	botón principal	botón central	botón secundario
	(izquierdo)	(central)	(derecho)
Abrir menú de Jmol	Ctrl. + clic o clic sobre el logotipo 'Jmol'		clic
Rotar en torno a X,Y	arrastrar
Mover a lo largo de X,Y (= trasladar)	Mayús. + doble-clic y arrastrar	doble-clic y arrastrar	Ctrl. + arrastrar
	el clic puede hacerse tanto sobre la molécula como fuera de ella
Restaurar y centrar	Mayús. + doble-clic*	doble-clic*
	*el clic debe hacerse fuera de la molécula
Rotar en torno a Z	Mayús. + arrastrar en horizontal	arrastrar en horizontal	Mayús. + arrastrar en horizontal (puede que falle en los Mac)
Reducir o ampliar	Mayús. + arrastrar en vertical	arrastrar en vertical
	o usar la rueda del ratón
	Implementado sólo a partir de la versión premilinar Jmol 10.00.22: Sólo funcionan tras una instrucción slab on
Seccionar desde el frente	Ctrl.+Mayús. + arrastrar (en vertical) *
Seccionar desde atrás	Ctrl.+Mayús. + doble-clic y arrastrar (en vertical) *
Desplazar la sección (manteniendo constante su grosor)	Alt.+Ctrl.+Mayús. + arrastrar (en vertical) *
	*si falla en un Mac, prueba pulsando primero el botón del ratón, luego pulsar las teclas Ctrl+Mayús., luego arrastrar
	Se puede probar el seccionado en esta página

Cómo seleccionar:

• Usa la instrucción 'picking' adecuada; por ej.:

set picking group

para activar/desactivar la selección de un residuo aminoácido completo al hacer clic en uno de sus átomos:

• al hacer clic en un átomo se cambiará su estado de selección.
• Es más útil cuando se ha establecido

set display selected

de modo que se está resaltando la selección.

Cómo hacer mediciones:

• Distancia (2 átomos):
  1. haz doble-clic en el átomo inicial
  2. para fijar una medición de distancia, haz doble-clic sobre el segundo átomo
• Ángulo (3 átomos):
  1. haz doble-clic en el átomo inicial
  2. haz clic en el segundo átomo (átomo central del ángulo)
  3. para fijar una medición de ángulo, haz doble-clic sobre el tercer átomo
• Ángulo de torsión o diedro (4 átomos)
  1. haz doble-clic en el átomo inicial
  2. haz clic en el segundo átomo
  3. haz clic en el tercer átomo
  4. para fijar una medición de ángulo diedro, haz doble-clic sobre el cuarto átomo
• En todos los casos:
  • mueve el puntero sobre el átomo destino para ver la medida sin dejarla permanente
  • mueve el puntero fuera de la ventana para cancelar la medición
  • repite la medición para que desaparezca

Contributors

NicolasVervelle, AngelHerraez, Pimpim